檔案文件收集是檔案整理的第1步，資料是否齊全直接影響到該檔案文件的價值，檔案文件整理主要包括對檔案文件的內容進行鑒別，將零散和需要進一步條理化的文件進行分類、組合、排列、編目、歸檔進行保存。

檔案整理時分類要合理，便于后期使用時方便查找，可按照年度和問題進行分類，就是將同一年的同一保管期限內，將問題相同的檔案文件放在一起，以后查找就比較方便。

按照檔案資料的保管期限標準進行整理，永遠和長期保存的檔案分類時要慎重，如果無法確定保管期限要按照就長不就短的原則執行，防止檔案使用時因保存時間過短被銷毀無法查詢，逐年對應便于查找。 

檔案整理要規范，當檔案的保管期限和分類順序確定后，就進入了裝訂、打號目錄錄入、掃描以及裝盒的環節，這個環節雖然簡單，但容易出錯，所以一定要仔細認真。

裝訂時要注意文件的針孔間距、頁邊距，否則裝訂出來影響美觀。案卷標題即案卷題名，是對卷內檔案文件的概括，所以，擬寫案卷標題內容要概括確切，文字簡要通順，以不超過50字為宜。

檔案的整理是一件細心的工作，檔案管理人員應具備較高的責任心，并加強檔案的日常檢查，這樣才能提高檔案的利用效果和作用。

無酸紙檔案盒可以使檔案文件長期保存不變質、不發霉的，可以對檔案文件起到保護作用，進行分類保存后便于查閱。

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